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Title:
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Modelización molecular de los receptores de adenosina y sus ligandos en el marco de diseño de fármacos asistido por ordenador
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Author:
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Gutiérrez de Terán Castañón, Hugo
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Email:
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hteran@xray.bmc.uu.se |
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Director:
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Sanz, Ferran
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Department/Institute:
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Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut |
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Resumen:
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El objetivo de la presente tesis es el de aportar conocimiento sobre la bioquímica y la farmacología de los receptores de adenosina, así como entender las relaciones entre estructura química y actividad farmacológica de los ligandos existentes para estos receptores. Con este objetivo se han empleado distintas técnicas y metodologías del diseño de fármacos asistido por ordenador. Los resultados presentados en este trabajo incluyen:
· El desarrollo de una estrategia original para la selección de una muestra que cubra adecuadamente la diversidad molecular existente en una base de datos de compuestos químicos · La construcción de un modelo de la región transmembrana del receptor A1 humano de adenosina, en el que se ha localizado y caracterizado un sitio de unión de agonistas compatible con los datos experimentales. · Predicciones teóricas de las energías de unión de ligandos, realizadas a partir de los complejos agonista-receptor predichos sobre el modelo mencionado, obteniendo un grado de acuerdo con los datos experimentales que resulta esperanzador |
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Abstract:
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The goal of the present thesis is to gain knowledge about the biochemistry and pharmacology of adenosine receptors, as well as to understand structure-activity relationships for the existing ligands for this receptors. In order to achieve this goal, we have used several techniques and methodologies from the computer-aided drug design field. Results presented in this work include:
· The development of an original strategy of selection of a maximum diversity sample that adequately covers the original molecular diversity contained in a compound database · The building of the transmembrane region of a human A1 adenosine receptor model. In such a model, an agonists binding site has been located and characterized, showing agreement with experimental data. · The resulting ligand-receptor complexes have been studied with computational approaches for the prediction of ligand-binding free energies. A nice correlation with experimental results was observed |
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Date of defense:
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2004-05-03 |
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Copyright deposit:
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B.43716-2004 |
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ISBN:
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846888524X |
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Keywords:
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modelización molecular exploración de acoplamiento de ligandos receptores acoplados a proteína G computer-aided drug design docking exploration G protein-coupled receptors molecular diversity adenosine molecular modeling diseño de fármacos asistido por ordenador diversidad molecular adenosina |
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Subject(s):
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577 - Bioquímica. Biologia molecular. Biofísica |
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Rights:
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