Diversity, dynamics and activity of Epsilonproteobacteria in a stratified karstic lake. Implications in carbon and sulfur cycles

dc.contributor
Universitat de Girona. Institut d'Ecologia Aquàtica
dc.contributor.author
Noguerola Solà, Imma
dc.date.accessioned
2017-06-12T13:05:49Z
dc.date.available
2017-06-12T13:05:49Z
dc.date.issued
2016-07-29
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/403813
dc.description.abstract
This doctoral thesis studies the abundance, diversity, seasonal dynamics and activity of Epsilonproteobacteria in a meromictic basin of Lake Banyoles during three year cycles. We applied a complementary array of molecular techniques to resolve the identity and ecological role of Epsilonproteobacteria in the system, with special focus on the contribution of these microorganisms on linking C and S cycles. Our results pointed to a clear seasonality of Epsilonproteobacteria, with maximal abundances at the redoxcline and upper monimolimnion in winter. Furthermore, results revealed the predominance of sequences affiliated to genus Arcobacter, and clearly indicated that Epsilonproteobacteria actively assimilated CO2 in the dark thus being responsible of the high rates of dark carbon fixation measured at the redoxcline in winter. Additional analyses provided additional evidence that the dominant member of the epsilonproteobacterial community is a chemolithotrophic, sulfide-oxidizing member of the genus Arcobacter, distantly related to its marine counterpart Candidatus A.sulfidicus.
en_US
dc.description.abstract
En aquesta tesi doctoral s’ha estudiat l’abundància, diversitat, dinàmica estacional i activitat dels Epsilonproteobacteria en una cubeta meromíctica de l’Estany de Banyoles durant tres cicles anuals. L’estudi combina diferents tècniques moleculars per resoldre la identitat i funció ecològica d’aquests microorganismes al sistema, amb especial atenció a la seva contribució als cicles del C i del S. Els resultats van mostrar una clara estacionalitat en l’abundància d’Epsilonproteobacteria amb màxims hivernals a la redoxclina i al monimolimnion, i van revelar un predomini de seqüències afiliades al gènere Arcobacter. A més, els resultats van demostrar que els Epsilonproteobacteria assimilen activament CO2 en la foscor, essent els responsables de les elevades taxes de fixació fosca de C mesurades a la redoxclina a l’hivern. Anàlisis moleculars complementàries van resoldre que el membre predominant de la comunitat estudiada és un microorganisme quimiolitotròfic i oxidador de sofre del gènere Arcobacter, filogenèticament emparentat amb l’espècie marina Candidatus A.sulfidicus.
en_US
dc.format.extent
130 p.
en_US
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
en_US
dc.publisher
Universitat de Girona
dc.rights.license
L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights.uri
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
*
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Epsilonproteobacteria
en_US
dc.subject
Arcobacter
en_US
dc.subject
Ecologia microbiana
en_US
dc.subject
Microbial ecology
en_US
dc.subject
Llacs estratificats
en_US
dc.subject
Stratified lakes
en_US
dc.subject
Lagos estratificados
en_US
dc.subject
Fixació fosca de carboni inorgànic
en_US
dc.subject
Dark inorganic carbon fixation
en_US
dc.subject
Fijación oscura de carbono inorgánico
en_US
dc.subject
Estany de Banyoles
en_US
dc.subject
Banyoles Lake
en_US
dc.subject
Lago de Banyoles
en_US
dc.title
Diversity, dynamics and activity of Epsilonproteobacteria in a stratified karstic lake. Implications in carbon and sulfur cycles
en_US
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
574
en_US
dc.subject.udc
579
en_US
dc.contributor.director
Borrego i Moré, Carles
dc.embargo.terms
cap
en_US
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess


Documents

tins1de1.pdf

10.09Mb PDF

This item appears in the following Collection(s)