Structural insights into “acid blobs and negative noodles” – The androgen receptor as a case study

Author

Szulc, Elizbieta Maria

Director

Salvatella i Giralt, Xavier

Tutor

Tauler Girona, Albert

Date of defense

2020-01-09

Pages

223 p.



Department/Institute

Universitat de Barcelona. Facultat de Farmàcia i Ciències de l'Alimentació

Abstract

Androgen receptor is a transcription factor that plays a key role in prostate cancer development and progression. Its N-terminal intrinsically disordered activation domain is an example of ill- structured negatively charged "acid blob" or "negative noodle" described in 1988 by Paul B. Sigler. In his model the transcription pre-initiation complex formation relies on non-specific interactions between the "negative noodles" of the transcriptional activating proteins and hydroxyl groups of the heptapeptide repeats of the C-terminal domain in the largest subunit of RNA polymerase II. Here, we take advantage of various biophysical methods to understand the AR activation domain characteristics, its ability to undergo liquid-liquid phase separation and the importance of both for protein-protein interactions of the domain. We show relevance of the secondary structure elements in the AD function despite its general "acid blob" character.

Keywords

Factors de transcripció; Factores de transcripción; Transcription factors; Càncer de pròstata; Cáncer de próstata; Prostate cancer; Andrògens; Andrógenos; Androgens; Proteïnes; Proteínas; Proteins

Subjects

577 - Material bases of life. Biochemistry. Molecular biology. Biophysics

Knowledge Area

Ciències de la Salut

Note

Programa de Doctorat en Biomedicina / Tesi realitzada a l'Institut de Recerca en Biomedicina de Barcelona (IRBB)

Documents

EMS_PhD_THESIS.pdf

13.75Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)