Sam68 and circRNA biogenesis in early development

Author

Antonelli, Maria Carla

Director

Tartaglia, Gian Gaetano

Bechara, Elias

Date of defense

2021-03-24

Pages

150 p.



Department/Institute

Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Doctorate programs

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

During the last decades the non-coding portion of the genome became subject of intense research due to its contribution to the complexity of biological and pathological processes. CircRNAs are a class of non-coding RNAs able to influence gene expression during development and their biogenesis relies on the activity of several RBPs. Indeed, the Signal Transduction and Activation of RNA (STAR) family members Quaking and Sam68 have been shown to be involved in the biogenesis of circRNAs in specific biological contexts, but whether their contribution is extended to embryonic development is unknown. Our evidences suggest that Sam68 is involved in circRNA biogenesis during differentiation towards cardiac lineage, providing a new layer of regulation during embryonic development.


Durante las últimas décadas, la parte no codificante del genoma se ha convertido en objeto de intensa investigación debido a su contribución a la complejidad de los procesos biológicos y patológicos. Los CircRNAs son una clase de RNA no codificante capaces de influir en la expresión génica durante el desarrollo y su biogénesis se basa en la actividad de varias proteínas que ligan el RNA llamadas RNA-Binding Proteins (RBPs). Se ha demostrado que varias RBPs están implicadas en la biogénesis de los circRNAs, especialmente Quaking y Sam68, miembros de la familia STAR (Signal Transduction and Activation of RNA) pero se desconoce si su contribución se extiende al desarrollo embrionario. Mi proyecto de doctorado tiene como objetivo desenredar esta brecha definiendo el papel de Sam68 en la biogénesis de circRNAs durante la diferenciación de células madre embrionarias (mESCs).

Keywords

CircRNAs; Sam68; Development; RBP; mESCs; STAR RBPs; Desarrollo

Subjects

575 - General genetics. General cytogenetics

Documents

tmca.pdf

57.05Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)