Development of tools for the analysis of cell-free DNA in human blood : Application in the noninvasive prenatal testing field

Author

Montaner Domènech, Anna

Director

González Ruiz, Juan Ramón

Date of defense

2019-11-11

Pages

232 p.



Department/Institute

Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Doctorate programs

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

discovery of cell-free DNA (cfDNA) in blood and the advent of massive parallel sequencing technologies has revolutionized the prenatal screening field by providing a better risk assessment of fetal chromosomal alterations than traditional first trimester screening alone and, as a consequence, potentially reducing the number of women unnecessarily undergoing confirmatory invasive diagnostic tests. The so-called noninvasive prenatal testing (NIPT) field is nowadays being exploited by worldwide companies racing to offer cfDNA tests covering an increasing number of fetal conditions, not without ethical concerns. This Thesis explores the use of targeted sequencing of Alu elements as an alternative cost-effective methodology for extracting biological information contained in cfDNA that can be applied in the NIPT field but also in other relevant clinical settings like cancer.


El descobriment d’ADN lliure circulant (ADNcir) en sang i el desenvolupament de tecnologies de seqüenciació massiva han revolucionat el camp del cribratge prenatal mitjançant una millor avaluació del risc d’alteracions cromosòmiques fetals respecte el cribratge tradicional del primer trimestre. Aquest fet, doncs, ha permès una potencial reducció del nombre de dones sotmeses a proves diagnòstiques invasives confirmatòries. L’anomenat camp de l’anàlisi prenatal no invasiu (TPNI) està sent explotat avui en dia per companyies d’arreu del món en una cursa per a oferir proves basades en l’ADNcir que cobreixen un nombre creixent de condicions fetals, no sense preocupacions ètiques. Aquesta Tesi explora l’ús de la seqüenciació massiva dirigida a elements Alu com una metodologia alternativa i rendible per a l’extracció d’informació biològica continguda en l’ADNcir aplicable no només en el camp de TPNI sinó també en d’altres entorns clínics rellevants com són el càncer.

Keywords

Cell-free DNA; Noninvasive prenatal testing; Alu; Masive parallel sequiencing; Aneuploidy; ADN lliure circulant; Anàlisi no invasiu prenatal; Seqúenciació massiva; Aneuploïdia

Subjects

575 - General genetics. General cytogenetics

Documents

tamd.pdf

6.392Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)