Association of polymers and small solute molecules with phospholipid membranes

Abstract

El present treball està dedicat a les aplicacions pràctiques de diversos mètodes teòrics i de simulació incloent la dinàmica molecular, Montecarlo i la mitjana dels càlculs del camp per entendre les propietats físiques del sistema bicapa lipídica, així com la interacció dels objectes a escala nanomètrica en contacte amb lípids desenvolupament i bicapes. En particular, el treball es tracten els següents temes: 1. Optimització i equilibri de propietats bicapes lipídiques utilitzant única cadena de la teoria de camp mig. 2. El desenvolupament del model i estudiar les propietats d'equilibri de bicapes de lípids oxidats amb camp mitjà i els mètodes de dinàmica molecular 3. Estudi de les propietats d'equilibri de doble capa amb nanopartícules utilitzant camp mitjà i els mètodes de Montecarlo. Optimització de polímer translocacional través de la tècnica 5. Mètodes estadístics GPU membrana utilitzats per a les propietats superficials de micro fulles d'alteració bicapes lipídiques.

El presente trabajo está dedicado a las aplicaciones prácticas de varios métodos teóricos y de simulación incluyendo la dinámica molecular, Monte Carlo y la media de los cálculos del campo para entender las propiedades físicas del sistema bicapa lipídica, así como la interacción de los objetos a escala nanométrica en contacto con lípidos desarrollo y bicapas. En particular, el trabajo se tratan los siguientes temas: 1. Optimización y equilibrio de propiedades bicapas lipídicas utilizando única cadena de la teoría de campo medio. 2. El desarrollo del modelo y estudiar las propiedades de equilibrio de bicapas de lípidos oxidados con campo medio y los métodos de dinámica molecular 3. Estudio de las propiedades de equilibrio de bicapa con nanopartículas utilizando campo medio y los métodos de Monte Carlo. Optimización de polímero translocacional través de la técnica 5. Métodos estadísticos GPU membrana utilizados para las propiedades superficiales de micro cuchillas de alteración bicapas lipídicas.

Present work is devoted to the development and practical applications of several theoretical and simulation methods including Molecular dynamics, Monte Carlo and Mean field calculations to understand the physical properties of the lipid bilayer system as well as the interaction of nano-scale object in contact with lipid bilayers. In partcular, the work covers the following topics: 1. Optimization and equilibrium properties of lipid bilayers using Single Chain Mean Field theory. 2. Developing the model and study the equilibrium properties of bilayers with oxidized lipids with mean field and molecular dynamics methods 3. Study the equilibrium properties of bilayer with nanoparticles using mean field and Monte Carlo methods4. Optimization of translocational polymer through membrane GPU technique 5. Statistical methods used to the surface properties of micro blades disrupting lipid bilayers.