New approaches to estimate microbial diversity of alcoholic fermentation

dc.contributor
Universitat Rovira i Virgili. Departament de Bioquímica i Biotecnologia
dc.contributor.author
Wang, Chunxiao
dc.date.accessioned
2016-07-13T10:05:19Z
dc.date.available
2016-12-25T06:45:10Z
dc.date.issued
2016-06-28
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/387309
dc.description.abstract
La fermentació alcohòlica la realitza una comunitat microbiana complexa, on els llevats vínics juguen un paper important. En els darrers anys, hi ha hagut un creixent interès per millorar complexitat del vi mitjançant fermentacions controlades quer utilitzaven no només S. cerevisiae sinó també soques seleccionades de llevats no-Saccharomyces. La investigació sobre la viabilitat dels llevats i les interaccions tenen un paper fonamental per entendre la diversitat de llevats en la fermentació mixta. En aquesta tesi, les tècniques independents de cultiu que es van aplicar per a l'anàlisi directa de mostres de vins inclouen la seqüenciació massiva, fluorescència per hibridació in situ (FISH) en combinació amb microscòpia i citometria de flux, RT-qPCR i EMA-DGGE. Aquestes tècniques independents de cultiu permeten una ràpida identificació i / o quantificació dels diferents llevats del vi. Aquestes tècniques han estat utilitzades en fermentacions espontànies a la regió del Priorat, i H. uvarum i Starm. bacillaris van ser les dues principals espècies de llevats no-Saccharomyces aïllades. H. uvarum o Starm. bacillaris perden gradualment la seva cultivabilitat quan els mostos es van inocular amb S. cerevisiae, però es podien quantificar cèl•lules de llevats en estat viable però no cultivable. La pèrdua de cultivabilitat dels no Saccharomyces va ser induïda principalment per alguns metabòlits secretats per S. cerevisiae, però els canvis en altres metabòlits principals també van influir. Aquesta interacció de llevat no Saccharomyces amb S. cerevisiae era específica d’espècie i soca.
cat
dc.description.abstract
La fermentación alcohólica es llevada a cabo por una comunidad microbiana compleja, donde las levaduras del vino juegan un papel importante. En los últimos años, ha habido un creciente interés para mejorar la complejidad del vino en fermentaciones controladas utilizando no sólo S. cerevisiae sino también algunas cepas seleccionadas de levaduras no-Saccharomyces. La investigación sobre la viabilidad de las levaduras y las interacciones tienen un papel fundamental para entender la diversidad de levaduras en fermentaciones mixtas. En esta tesis, se aplicaron técnicas independientes de cultivo para el análisis de muestras de vinos directa incluyendo la secuenciación masiva, fluorescencia por hibridación in situ (FISH) en combinación con microscopía y citometría de flujo, RT-qPCR y EMA-DGGE. Estas técnicas independientes de cultivo permiten una rápida identificación y / o cuantificación de las distintas levaduras del vino. Estas técnicas han sido utilizadas para el análisis de fermentaciones espontáneas en la región del Priorat, siendo las especies H. uvarum y Starm. bacillaris las dos principales especies de levaduras no-Saccharomyces. H. uvarum o Starm. bacillaris pierden gradualmente su cultivabilidad cuando los mostos se inocularon con S. cerevisiae, pero las levaduras se pudieron cuantificar en estado viable pero no cultivable. La pérdida de cultivabilidad de las especies no Saccharomyces fue inducida principalmente por algunos metabolitos secretados por S. cerevisiae, pero los cambios en otros metabolitos principales también influyen. Esta interacción entre levaduras no Saccharomyces con S. cerevisiae es especie y cepa dependiente.
spa
dc.description.abstract
Alcoholic fermentation is driven by complex microbial community, where wine yeasts play an important role. In recent years, there has been growing interest to enhance wine complexity by controlled fermentations using not only S. cerevisiae but also together with some selected non-Saccharomyces yeast strains. Research on yeast viability and interaction has a fundamental role to understand the diversity of yeast in mixed fermentations. In this thesis, culture-independent techniques were developed and applied for direct wine sample analysis including massive sequencing, fluorescence in situ hybridization (FISH) combined with microscopy and flow cytometry, RT-qPCR and EMA-DGGE. These culture-independent techniques enable fast identification and/or quantification of different wine yeasts. These techniques have been used during spontaneous fermentation in Priorat region, and H. uvarum and Starm. bacillaris where the two main non-Saccharomyces yeast species detected. H. uvarum or Starm. bacillaris gradually lost their culturability when musts were inoculated with S. cerevisiae, but quantifiable yeast cells existed in viable but non-culturable state. The culturability loss of non-Saccharomyces was mainly induced by some metabolites secreted from S. cerevisiae, but changes in other main metabolites also had some effect. This interaction of non-Saccharomyces yeast with S. cerevisiae showed the specificity of species and strains.
eng
dc.format.extent
236 p.
cat
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
cat
dc.publisher
Universitat Rovira i Virgili
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
interacció entre llevats
cat
dc.subject
viables però no cultivables
cat
dc.subject
no-Saccharomyces
cat
dc.subject
interacción entre levaduras
cat
dc.subject
viables pero no cultivables
cat
dc.subject
wine
cat
dc.subject.other
Ciències
cat
dc.title
New approaches to estimate microbial diversity of alcoholic fermentation
cat
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
57
cat
dc.subject.udc
577
cat
dc.subject.udc
579
cat
dc.subject.udc
663/664
cat
dc.contributor.director
Mas Barón, Albert
dc.contributor.codirector
Esteve Zarzoso, Braulio
dc.embargo.terms
6 mesos
cat
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess


Documentos

TESI.pdf

7.712Mb PDF

Este ítem aparece en la(s) siguiente(s) colección(ones)