Antimicrobial activity in Bacillus spp. from plant environments against plant pathogens. Relationship with cyclic lipopeptide genes and products

dc.contributor
Universitat de Girona. Departament d'Enginyeria Química, Agrària i Tecnologia Agroalimentària
dc.contributor.author
Mora Pons, Isabel
dc.date.accessioned
2014-01-10T13:04:56Z
dc.date.available
2014-01-10T13:04:56Z
dc.date.issued
2013-12-12
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/128416
dc.description.abstract
Bacillus subtilis and related species have strong interest in agriculture because several strains are biocontrol agents of plant diseases, which have been recognized as biosafe. In this work, a selective enrichment procedure based on PCR targeting antimicrobial peptide (AMP) genes has been designed and evaluated to screen field samples and pure cultures of Bacillus spp. The procedure increased the yield of isolation of Bacillus strains compared to the standard procedure. The isolates were characterized according to the presence of six AMP genes, the capacity to produce AMPs, and their antimicrobial activity against fungal and bacterial plant pathogens. The relationships between AMP genes, products and antimicrobial activity have been established. Finally, a collection of 184 Bacillus has been obtained having multiple AMP genes simultaneously, and producing several cyclic lipopeptides, with a wide range of antimicrobial activity. It is expected that such strains would be suitable candidates to develop novel biopesticides for plant disease control
eng
dc.description.abstract
Bacillus subtilis i les espècies relacionades són de gran interès per l'agricultura, gràcies a la seva implicació en el biocontrol de malalties de plantes, i ser reconeguts com a biosegurs. En aquest treball s'ha dissenyat i avaluat un procés d'enriquiment selectiu basat en la detecció de gens relacionats amb la síntesis de pèptids antimicrobians, per tal d'analitzar mostres naturals i cultius purs de Bacillus. El procediment va permetre un increment d'aïllament de Bacillus en comparació al mètode estàndard d'aïllament. Els aïllats van ser caracteritzats segons la presencia de sis gens biosintètics, la capacitat de produir ciclolipopèptids i la seva activitat antimicrobiana contra fongs i bacteris patògens de plantes. Es van establir les relacions existents entre la presència del gens biosintètics, els productes i l'activitat antimicrobiana. Finalment, es va obtenir una col•lecció de 184 aïllats de Bacillus amb múltiple presència de gens biosintètics de pèptids antimicrobians simultàniament, productors de varis ciclolipopèptids, i amb un ampli espectre d'activitat antimicrobiana. És d'esperar que aquests aïllats resultin bons candidats per desenvolupar nous biopesticides per al control de malalties de plantes
cat
dc.format.extent
314 p.
cat
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
cat
dc.publisher
Universitat de Girona
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Bacillus
cat
dc.subject
Cyclic lipopeptides
cat
dc.subject
Lipopèptids cíclics
cat
dc.subject
Lipopéptidos cíclicos
cat
dc.subject
Antimicrobial
cat
dc.subject
Antimicrobià
cat
dc.subject
Antimicrobiano
cat
dc.subject
Genes
cat
dc.subject
Gens
cat
dc.subject
Peptides
cat
dc.subject
Pèptids
cat
dc.subject
Péptidos
cat
dc.subject
Plant pathogens
cat
dc.subject
Patògens de plantes
cat
dc.subject
Patógenos de plantas
cat
dc.title
Antimicrobial activity in Bacillus spp. from plant environments against plant pathogens. Relationship with cyclic lipopeptide genes and products
cat
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
579
cat
dc.contributor.director
Montesinos Seguí, Emilio
dc.contributor.director
Cabrefiga Olamendi, Jordi
dc.embargo.terms
cap
cat
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.identifier.dl
Gi. 121-2014
cat


Documents

timp.pdf

5.313Mb PDF

This item appears in the following Collection(s)