Detecció de guanys i pèrdues de material genètic en tumors sòlids

Author

Armengol Rosell, Gemma

Director

Caballín, M. R. (María Rosa)

Date of defense

2000-01-13

ISBN

9788469131787

Legal Deposit

B-20717-2008



Department/Institute

Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia

Abstract

Durant molts anys la citogenètica ha estat l'únic mètode disponible per a analitzar els canvis genètics en els tumors. Malgrat això, els estudis cariotípics estan sovint obstaculitzats per problemes tècnics i metodològics. L'any 1992 es va descriure una nova estratègia, que es coneix com hibridació genòmica comparada (CGH), i que identifica en un sol experiment aquelles regions que s'hagin amplificat (indicadores d'oncogens), així com regions delecionades (indicadores de gens supressors de tumors). En aquesta tesi s'han estudiat 37 mostres de tumors de la família Ewing (ET), vuit xenografts de tumors pancreàtics i set metàstasis de tumors pancreàtics originades en els ratolins. En totes les mostres s'ha aplicat la CGH. En els ET s'han detectat guanys recurrents del braç llarg del cromosoma 1 (mínima regió comuna 1q21-q22), i guanys dels cromosomes 8 i 12, així com guany de 7q i 6p2,1-pter i pèrdua de 16q. Aquestes regions podrien contenir gens importants en el desenvolupament i/o progressió dels ET. Mitjançant Southern blot s'ha detectat l'amplificació de dos gens, FLG i SPRR 3, localitzats a 1q21. A més, mitjançant una anàlisi estadística s'ha observat que els guanys de 6p estaven associats a un pitjor pronòstic. També s'ha desenvolupat una nova estratègia, la CGH amb mescles de DNAs de diferents mostres del mateix tipus tumoral. Aquesta tècnica permet detectar en un únic experiment les alteracions presents a la majoria de les mostres. En el present estudi s'ha demostrat l'eficàcia d'aquest mètode amb nombroses mostres (14-28) de sis tipus tumorals diferents, que prèviament s'havien estudiat individualment. En els tumors pancreàtics s'han detectat guanys en els cromosomes 8 (8q24),15 (15q25-q26),16, 20q i 19q, i pèrdues en els cromosomes 18 (18q21), 6 (6q21 i 6q24-qter), 13 (13q21) i 10 (10q 14-pter), en ordre decreixent de freqüència. Els estudis de pèrdues al·lèliques a 10p14-pter no han permès una delimitació més exacta de la regió afectada, ja que tots els casos amb pèrdua per CGH han mostrat pèrdues al·lèliques per a tots els loci informatius. Les regions cromosòmiques 8q24 i 15q25-qter s'han estudiat amb més detall per hibridació in situ fluorescent i Southern blot. L'estudi dels oncogens MYC a 8q24 i FES i IGF1R a 15q25-qter ha mostrat, en general, un baix nivell d'amplificació. Podria ésser que solament unes poques còpies extra d'aquests gens fossin suficients per a tenir efectes en la tumorogènesi pancreàtica o bé que fossin altres gens localitzats en aquestes regions els que realment estarien amplificats i els quals jugarien un paper important en la carcinogènesi pancreàtica. D'altra banda, s'ha observat una forta relació clonal entre les metàstasis estudiades i els tumors originaris implantats en els ratolins. Totes les metàstasis tenien les mateixes alteracions que els implants i, a més, noves alteracions que podrien contenir gens relacionats amb la progressió metastàtica del carcinoma de pàncreas. La majoria d'aquestes alteracions addicionals ja estaven presents en els subclons de l'implant, però no en proporció suficient com per a ser detectades per CGH.

Keywords

CGH; Tumors sòlids; Guanys

Subjects

577 - Material bases of life. Biochemistry. Molecular biology. Biophysics

Knowledge Area

Ciències Experimentals

Documents

gar1de1.pdf

6.079Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)