dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Generoso, Serena Francesca
dc.date.accessioned
2019-04-02T15:46:25Z
dc.date.available
2021-03-21T00:00:28Z
dc.date.issued
2019-03-21
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/666581
dc.description.abstract
X-Chromosome Reactivation (XCR) occurs in the epiblast cells of the blastocyst and in germ cells,
thereby coupling XCR with pluripotency. We performed a screen in iPS cells by knocking down the
expression of candidate genes picked from a single cell microarray expression profile in blastocysts.
We thereby identified candidates which had an effect on both pluripotency and X-Reactivation.
However, we also identified factors with a specific role in XCR. This suggests that XCR is not an
absolute requirement for iPSC reprogramming and that the two processes can be uncoupled. Among
these factors, there was the cohesin complex member Smc1a. In experiments based on Super
resolution microscopy (STORM), we observed a preferential enrichment of Smc1a on the active
compared to inactive X, suggesting a role in shaping the Xa structure. Therefore, we conclude that
cohesin-mediated changes in X-chromosome structure are a key step during the XCR process.
en_US
dc.description.abstract
La reactivación del cromosoma X (XCR) ocurre en las células epiblásticas del blastocisto y en las
células germinales, acoplando XCR con la pluripotencia. Se realizó un cribaje durante la
reprogramación de iPSC reduciendo la expresión de genes candidatos, seleccionados a partir de un
microarray de expresión en blastocitos. Se identificaron factores con un efecto tanto en la
pluripotencia como en la XCR y factores con un rol específico en la XCR. Esto sugiere que la XCR
no es un requisito absoluto para la reprogramación de las iPSC, y que los dos procesos se pueden
desacoplar. Se identificó el miembro Smc1a del complejo de cohesina. Mediante microscopía de
súper resolución (STORM) se observó un enriquecimiento preferencial de Smc1a en el cromosoma
X activo en comparación con el X inactivo, lo que sugiere un papel en la configuración de la estructura
del X activo. Por lo tanto, concluimos que los cambios mediados por cohesina en la estructura del
cromosoma X son un paso clave durante el proceso de XCR.
en_US
dc.format.extent
197 p.
en_US
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
en_US
dc.publisher
Universitat Pompeu Fabra
dc.rights.license
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Pluripotency
en_US
dc.subject
Cell reprogramming
en_US
dc.subject
X-Reactivation
en_US
dc.subject
X-Chromosome structure
en_US
dc.subject
Pluripotencia
en_US
dc.subject
Reprogramación celular
en_US
dc.subject
Reactivación del X
en_US
dc.subject
Estructura del cromosoma X
en_US
dc.title
A Screen for novel factors involved in pluripotency and X-chromosome reactivation
en_US
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.contributor.authoremail
serena.generoso@crg.eu
en_US
dc.contributor.director
Payer, Bernhard
dc.embargo.terms
cap
en_US
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina