The regulatory landscape of Drosophila imaginal disc regeneration

dc.contributor
Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística
dc.contributor.author
Vizcaya Molina, Elena
dc.date.accessioned
2019-04-12T07:44:08Z
dc.date.available
2019-04-12T07:44:08Z
dc.date.issued
2018-12-19
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/666641
dc.description.abstract
One of the most important questions in regenerative biology is how and when genes change expression to trigger regeneration programs. Resetting of gene expression patterns during injury responses is shaped by the coordinated action of genomic regions that integrate the activity of multiple sequence-specific DNA binding proteins. Using genome-wide approaches to interrogate chromatin function we identify the regulatory elements governing tissue recovery in Drosophila imaginal discs, which show a high regenerative capacity after genetically induced cell death. Our findings indicate a global co-regulation of gene expression as well as the existence of a regeneration program driven by different types of regulatory elements. Novel enhancers acting exclusively in the damaged tissue cooperate with enhancers co-opted from other tissues and developmental stages, and with endogenous enhancers that show increased activity after injury. These enhancers host binding sites for regulatory proteins, including a core set of conserved transcription factors that regulate regeneration across metazoans.
en_US
dc.description.abstract
Una de les preguntes més freqüents en el camp de la biologia regenerativa és com i quan els gens poden canviar els seus patrons d’expressió per accionar els programes gènics requerits a la regeneració. Durant la resposta al dany, els patrons d’expressió dels gens son re-iniciats, en part, gràcies a la funció coordinada de regions genòmiques reguladores. Aquestes, integren l’activitat de diferents proteïnes d’unió a seqüències específiques de l’ADN. Mitjançant l'ús de tècniques d’anàlisi massiva hem interrogat la funció de la cromatina i hem identificat les regions reguladores encarregades de dur a terme la regeneració dels discos imaginals de Drosophila. Aquests són estructures primordials que presenten una elevada capacitat regenerativa rere la inducció de mort cel·lular per ablació genètica. Els nostres resultats indiquen que durant la regeneració hi ha co-regulació de l’expressió gènica i que els programes regeneratius són orquestrats per diferents classes de regions reguladores. Els novel enhancers actuen exclusivament durant la regeneració i cooperen amb enhancers reclutats d’altres teixits o estadis del desenvolupament, així com amb enhancers endògens que presenten una elevada accessibilitat en resposta al dany. Els tres tipus d’elements reguladors presenten seqüències específiques per proteïnes d’unió l’ADN, incloent un set de factors de transcripció que no només es troba conservat però també requerit a la regeneració a través dels metazoas.
en_US
dc.format.extent
190 p.
en_US
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.language.iso
eng
en_US
dc.publisher
Universitat de Barcelona
dc.rights.license
L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.uri
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
*
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Regeneració (Biologia)
en_US
dc.subject
Regeneración (Biología)
en_US
dc.subject
Regeneration (Biology)
en_US
dc.subject
Factors de transcripció
en_US
dc.subject
Factores de transcripción
en_US
dc.subject
Transcription factors
en_US
dc.subject
Drosòfila
en_US
dc.subject
Drosophila
en_US
dc.subject.other
Ciències Experimentals i Matemàtiques
en_US
dc.title
The regulatory landscape of Drosophila imaginal disc regeneration
en_US
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.subject.udc
575
en_US
dc.contributor.director
Corominas, Montserrat (Corominas Guiu)
dc.contributor.tutor
Corominas, Montserrat (Corominas Guiu)
dc.embargo.terms
cap
en_US
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess


Documents

EVM_PhD_THESIS.pdf

9.029Mb PDF

Aquest element apareix en la col·lecció o col·leccions següent(s)