Native American genetic history through admixed populations of Brazil

Abstract

Most of the Native American populations that lived in nowadays Eastern Brazil when the Europeans established in the area in the 16th century do not exist anymore. The colonization of Brazil implied huge migrations from Europe and brought more than four million people from sub-Saharan Africa from the 16th to the 19th centuries to work as slaves. This process disrupted the demography of the Native American populations from eastern Brazil, which disappeared or experienced admixture events with the European colonizers, the sub-Saharan slaves and their descendants to become urban admixed Brazilian populations. Therefore, the genetic history of Native American populations from eastern Brazil might only be traced from urban admixed Brazilians or through the few surviving Native American populations that also received, in a lesser extent, geneflow from European and sub-Saharan sources. This thesis presents two novel methodologies to isolate and analyse the Native American ancestry from these populations to reconstruct the Native American genetic structure before the arrival of Europeans. The main findings reveal a population landscape shaped by a dichotomy of Tupi and Je ancestries and contribute to the revision and rescheduling of the major demographic events before 1500CE.

La gran part de les poblacions natives americanes que vivien a les terres que avui en dia són l’est del Brasil ja no existeixen. La colonització del Brasil va comportar grans migracions des d’Europa i va arrencar més de quatre milions de persones de l’Àfrica sub-sahariana des del segle XVI fins al segle XIX per treballar esclavitzades al Brasil. Aquest procés va alterar la demografia de les poblacions Natives Americanes de l’est del Brasil, que van desaparèixer o es van mesclar amb els colonitzadors europeus, els esclaus sub-saharians, o els seus descendents per esdevenir poblacions brasileres mestisses. Com a conseqüència, per tal de conèixer la història genètica de les poblacions natives americanes de l’est del Brasil cal traçar-la a través de les poblacions brasileres mestisses urbanes o de les poques poblacions natives americanes supervivents, que en menor mesura també han rebut l’impacte genètic de poblacions d’origen europeu o sub-saharià. Aquesta tesi presenta dues noves metodologies per aïllar i analitzar la part ancestral nativa americana d’aquestes poblacions per tal de reconstruir l’estructura genètica de les poblacions natives americanes abans de l’arribada dels europeus. Els descobriments principals revelen un escenari modelat per una dicotomia de les ancestralitats Tupi i Je i contribueixen a la revisió i reestructuració dels principals esdeveniments demogràfics abans del 1500.