Variations of Polycomb assembly in mouse embryonic stem cells and early differentiation

Author

Mocavini, Ivano

Director

Di Croce, Luciano

Date of defense

2022-03-31

Pages

166 p.



Department/Institute

Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut

Doctorate programs

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

Polycomb repressive complex (PRC)1 and 2 are major players in gene regulation, devoted to maintenance of the epigenetic memory of gene silencing. Mouse embryonic stem cells (mESCs) have been extensively exploited as a model system to study Polycomb complexes composition and function, leading to the identification of many accessory factors. However, the mechanisms regulating PRC1/2 composition in mESCs are still poorly understood. Moreover, several reports have shown that changes in composition occur upon cell differentiation, although little is known about the functional relevance of these changes. In this doctoral thesis I aim to address these questions by focusing on two examples of these aspects: first, I characterize the PRC1 interactome upon mESCs differentiation to primitive endoderm (PrE) and try to assess its role in this cell fate transition. Secondly, I report the identification of a novel splicing isoform of PRC2 core component Suz12, with implications in PRC2 composition and activity on chromatin


Los complejos de represión Polycomb (PRC)1 y 2 juegan un papel central en la regulación de la expresión génica, preservando la memoria epigenética del estado de silenciamiento. El uso de células madre embrionarias de ratón (mESCs) como modelo para el estudio de los complejos Polycomb, ha permitido la identificación de muchos factores accesorios. Sin embargo, no se conocen los mecanismos que regulan la composición de PRC1/2 en las mESCs. Además, varios informes han demostrado que, tras la diferenciación celular, ocurren ciertos cambios en la composición, aunque se sabe poco sobre la relevancia funcional de estos. En esta tesis doctoral trato de abordar estas cuestiones centrándome en dos ejemplos concretos: primero, caracterizo la red de proteínas asociadas a PRC1 tras la diferenciación de mESCs al endodermo primitivo (PrE), e intento evaluar su rol durante esta transición de identidad celular. En segundo lugar, informo del hallazgo de una nueva isoforma de splicing de Suz12, un componente central de PRC2, con implicaciones para la composición y la actividad de PRC2 en la cromatina.

Keywords

Epigenetics; Chromatin; Polycomb; Pluripotency; Development; Llave; Epigenética; Cromatina; Pluripotència; Desarrollo

Subjects

575 - General genetics. General cytogenetics

Documents

tim.pdf

17.33Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)