dc.contributor
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.contributor.author
Bajew, Simon
dc.date.accessioned
2022-04-25T15:39:36Z
dc.date.available
2024-04-12T22:05:15Z
dc.date.issued
2022-04-12
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/10803/674111
dc.description.abstract
Alternative splicing is a post-transcriptional process that allows the generation of
multiple transcript and protein isoforms from a single gene by differential processing
of exons and introns. This Thesis focuses on microexons, the shortest class of exons,
previously characterised in the nervous system of vertebrates as functionally important
and regulated by the protein SRRM4. Here, we provide evidence for a program of
microexon regulation in endocrine pancreas that is controlled SRRM3, a paralog of
SRRM4 sharing an ancestral domain required for microexon inclusion. We find that
endocrine pancreas uses a subset of the neural microexon program, forming a nested
program of neuroendocrine microexons. We also show that the correct inclusion of
these microexons (EndoMICs) is important for the secretory function of pancreatic
islets. Finally, we provide insights into the mechanisms by which the nested program
of neuroendocrine microexons is differentially regulated between neural and
endocrine pancreatic tissues.
dc.description.abstract
El empalme alternativo es un proceso postranscripcional que permite la generación
de múltiples isoformas de transcripción y proteína a partir de un solo gen mediante el
procesamiento diferencial de exones e intrones. Esta tesis se centra en los
microexones, la clase más corta de exones, previamente caracterizados en el sistema
nervioso de los vertebrados como funcionalmente importantes y regulados por la
proteína SRRM4. Aquí, proporcionamos evidencias para un programa de regulación
de microexones en el páncreas endocrino que está controlado por SRRM3,
un parálogo de SRRM4 que comparte un dominio ancestral requerido para la
inclusión de microexones. Encontramos que el páncreas endocrino utiliza un
subconjunto del programa de microexones neurales, formando un programa anidado
de microexones neuroendocrinos. También mostramos que la correcta inclusión de
estos microexones (EndoMICs) es importante para la función secretora de los islotes
pancreáticos. Finalmente, proporcionamos información sobre los mecanismos por los
cuales el programa anidado de microexones neuroendocrinos se regula de manera
diferencial entre los tejidos neurales y pancreáticos endocrinos
dc.format.mimetype
application/pdf
dc.rights.license
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dc.rights.uri
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
*
dc.source
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.subject
Alternative splicing
dc.subject
Endocrine pancreas
dc.subject
Cis-regulatory elements
dc.subject
High-throughput library
dc.subject
Empalme alternativo
dc.subject
Pancreas endocrino
dc.subject
Elementos reguladores en cis
dc.subject
Librería de alto rendimiento
dc.title
SRRM3 regulates a subprogram of highly sensitive microexons important for pancreatic endocrine function
dc.type
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.contributor.authoremail
simon.bajew@crg.eu
dc.contributor.director
Valcárcel, J. (Juan)
dc.contributor.director
Irimia, Manuel
dc.rights.accessLevel
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.description.degree
Programa de doctorat en Biomedicina