Great ape genomics : diversity and evolution

Abstract

Els grans simis són els nostres parents evolutius més propers i com a tals són la millor eina per entendre els nostres orígens més recents. Mitjançant la genòmica comparativa ara podem estudiar en profunditat aquesta qüestió, però la manca de genomes de grans simis no ha permès una anàlisi completa d’aquesta i d’altres qüestions relacionades amb la família Hominidae. En el context de la revolució de la seqüenciació, en aquesta tesi presento les meves contribucions en l’estudi de la genòmica de grans simis. Començant des de l’estudi de genomes individualment, faig un resum de les troballes més importants del panell més complet de genomes de grans simis, on vam incloure totes les espècies i la majoria de subespècies d’aquesta família i vam proporcionar una visió sense precedents en diversitat genètica, demografia i estructura de la població. També discuteixo les implicacions més rellevants d’aquest treball i com aquest pot ser una eina important en la conservació dels grans simis.

Great apes are our closest relatives and as such they are our best resource to understand our recent origins. Through comparative genomics we can fully investigate this question, but the lack of great ape genomes have precluded to have a complete view on this and many other questions related to the Hominidae family. In the context of the current sequencing revolution, herein I present the contributions I have made in the study of great ape genomes. Starting from studies studying single genomes and following with the analysis of diversity in multiple great ape genomes, I summarize the findings in the most complete dataset of great ape genomes, covering all great ape species and most subspecies, providing an unprecedented view on diversity, demography and population structure in great apes. I finally discuss the most relevant implications of this work and how this can boost the conservation efforts in the protection of great apes.